Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- s -

• S : CDPL::Chem::AtomConfiguration , CDPL::Chem::AtomType
• s : CDPL::Chem::CIPDescriptor
• S : CDPL::Chem::CIPDescriptor
• S_2 : CDPL::Chem::SybylAtomType , CDPL::ForceField::UFFAtomType
• S_3 : CDPL::Chem::SybylAtomType
• S_3_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• S_3_4 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• S_3_6 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• S_H2S : CDPL::MolProp::HBondDonorAtomType
• S_HS : CDPL::MolProp::HBondDonorAtomType
• S_HSCN : CDPL::MolProp::HBondDonorAtomType
• S_O : CDPL::Chem::SybylAtomType
• S_O2 : CDPL::Chem::SybylAtomType
• S_R : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• S_SULFIDE : CDPL::MolProp::HBondAcceptorAtomType
• S_THIOL : CDPL::MolProp::HBondDonorAtomType
• S_THIOUREA : CDPL::MolProp::HBondAcceptorAtomType
• SACCHARIDE : CDPL::Biomol::ResidueType , CDPL::Chem::MOL2MoleculeType
• SACCHARIDE_LINKING : CDPL::Biomol::ResidueType
• SArray : CDPL::Util
• Sb : CDPL::Chem::AtomType
• Sb_3_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• Sc : CDPL::Chem::AtomType
• Sc_3_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• SD3 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SDF : CDPL::Chem::DataFormat
• SDF_BZ2 : CDPL::Chem::DataFormat
• SDF_GZ : CDPL::Chem::DataFormat
• SDFBZ2MolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SDFBZ2MolecularGraphWriter : CDPL::Chem
• SDFBZ2MoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SDFBZ2MoleculeReader : CDPL::Chem
• SDFGZMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SDFGZMolecularGraphWriter : CDPL::Chem
• SDFGZMoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SDFGZMoleculeReader : CDPL::Chem
• SDFMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SDFMoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• Se : CDPL::Chem::AtomType , CDPL::Chem::SybylAtomType
• Se_3_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• SECONDARY_ATOM_LABEL_FONT : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault , CDPL::Vis::MolecularGraphProperty , CDPL::Vis::MolecularGraphPropertyDefault
• SECONDARY_ATOM_LABEL_SIZE : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault , CDPL::Vis::MolecularGraphProperty , CDPL::Vis::MolecularGraphPropertyDefault
• SECONDARY_LABEL_FONT : CDPL::Vis::AtomProperty , CDPL::Vis::AtomPropertyDefault
• SECONDARY_LABEL_SIZE : CDPL::Vis::AtomProperty , CDPL::Vis::AtomPropertyDefault
• SEESAW : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• seqCis : CDPL::Chem::CIPDescriptor
• seqTrans : CDPL::Chem::CIPDescriptor
• SERIAL_NUMBER : CDPL::Biomol::AtomProperty
• set2DCoordinates() : CDPL::Chem
• set2DStereoFlag() : CDPL::Chem
• set3DCoordinates() : CDPL::Chem
• set3DCoordinatesArray() : CDPL::Chem
• setAgentAlignment() : CDPL::Vis
• setAgentLayout() : CDPL::Vis
• setAgentLayoutDirection() : CDPL::Vis
• setAlignmentParameter() : CDPL::Vis
• setAltLocationID() : CDPL::Biomol
• setAromaticityFlag() : CDPL::Chem
• setAromaticityFlags() : CDPL::Chem
• setAromaticSubstructure() : CDPL::Chem
• setArrowColor() : CDPL::Vis
• setArrowHeadLength() : CDPL::Vis
• setArrowHeadWidth() : CDPL::Vis
• setArrowLength() : CDPL::Vis
• setArrowLineWidth() : CDPL::Vis
• setArrowShaftWidth() : CDPL::Vis
• setArrowStyle() : CDPL::Vis
• setAtomColor() : CDPL::Vis
• setAtomColorParameter() : CDPL::Vis
• setAtomColorTable() : CDPL::Vis
• setAtomColorTableParameter() : CDPL::Vis
• setAtomConfigurationLabelFont() : CDPL::Vis
• setAtomConfigurationLabelFontParameter() : CDPL::Vis
• setAtomConfigurationLabelSize() : CDPL::Vis
• setAtomConfigurationLabelSizeParameter() : CDPL::Vis
• setAtomLabelFont() : CDPL::Vis
• setAtomLabelFontParameter() : CDPL::Vis
• setAtomLabelMargin() : CDPL::Vis
• setAtomLabelMarginParameter() : CDPL::Vis
• setAtomLabelSize() : CDPL::Vis
• setAtomLabelSizeParameter() : CDPL::Vis
• setAtomMapping() : CDPL::Chem
• setAtomMappingID() : CDPL::Chem
• setAtomMatchConstraints() : CDPL::Chem
• setAtomSymbolsFromTypes() : CDPL::Chem
• setAtomTypesFromSymbols() : CDPL::Chem
• setBackgroundColorParameter() : CDPL::Vis
• setBFactor() : CDPL::Biomol
• setBondColor() : CDPL::Vis
• setBondColorParameter() : CDPL::Vis
• setBondConfigurationLabelFont() : CDPL::Vis
• setBondConfigurationLabelFontParameter() : CDPL::Vis
• setBondConfigurationLabelSize() : CDPL::Vis
• setBondConfigurationLabelSizeParameter() : CDPL::Vis
• setBondLabelFont() : CDPL::Vis
• setBondLabelFontParameter() : CDPL::Vis
• setBondLabelMargin() : CDPL::Vis
• setBondLabelMarginParameter() : CDPL::Vis
• setBondLabelSize() : CDPL::Vis
• setBondLabelSizeParameter() : CDPL::Vis
• setBondLengthParameter() : CDPL::Vis
• setBondLineSpacing() : CDPL::Vis
• setBondLineSpacingParameter() : CDPL::Vis
• setBondLineWidth() : CDPL::Vis
• setBondLineWidthParameter() : CDPL::Vis
• setBondMatchConstraints() : CDPL::Chem
• setBondMemberSwapStereoFixParameter() : CDPL::Chem
• setCanonicalNumber() : CDPL::Chem
• setCDFWriteSinglePrecisionFloatsParameter() : CDPL::Chem , CDPL::Grid , CDPL::Pharm
• setChainID() : CDPL::Biomol
• setCheckLineLengthParameter() : CDPL::Biomol , CDPL::Chem
• setCIPConfiguration() : CDPL::Chem
• setCIPPriority() : CDPL::Chem
• setColor() : CDPL::Vis
• setCombineInterferingResidueCoordinatesParameter() : CDPL::Biomol
• setComment() : CDPL::Chem
• setComponentGroupID() : CDPL::Chem
• setComponentGroups() : CDPL::Chem
• setComponentLayout() : CDPL::Vis
• setComponentLayoutDirection() : CDPL::Vis
• setComponentMargin() : CDPL::Vis
• setComponentMatchConstraints() : CDPL::Chem
• setComponents() : CDPL::Chem
• setConfigurationLabelFont() : CDPL::Vis
• setConfigurationLabelSize() : CDPL::Vis
• setConfIndexNameSuffixPatternParameter() : CDPL::Chem
• setConformation() : CDPL::Chem
• setConformationIndex() : CDPL::Chem
• setConformerEnergies() : CDPL::Chem
• setConformers() : CDPL::ConfGen
• setCoordinatesDimensionParameter() : CDPL::Chem
• setCyclicSubstructure() : CDPL::Chem
• setDirection() : CDPL::Chem
• setDisabledFlag() : CDPL::Pharm
• setDoubleBondTrimLength() : CDPL::Vis
• setDoubleBondTrimLengthParameter() : CDPL::Vis
• setFeatureType() : CDPL::GRAIL
• setFormalCharge() : CDPL::Chem
• setGeometricalDistanceMatrix() : CDPL::Chem
• setGeometry() : CDPL::Pharm
• setHashCode() : CDPL::Chem
• setHBondAcceptorType() : CDPL::MolProp
• setHBondDonorType() : CDPL::MolProp
• setHeteroAtomFlag() : CDPL::Biomol
• setHybridizationState() : CDPL::Chem
• setHydrogenResidueSequenceInfo() : CDPL::Biomol
• setHydrophobicity() : CDPL::MolProp , CDPL::Pharm
• setImplicitHydrogenCount() : CDPL::Chem
• setINCHIInputOptionsParameter() : CDPL::Chem
• setINCHIOutputOptionsParameter() : CDPL::Chem
• setIsotope() : CDPL::Chem
• setJMESeparateComponentsParameter() : CDPL::Chem
• setLabelFont() : CDPL::Vis
• setLabelMargin() : CDPL::Vis
• setLabelSize() : CDPL::Vis
• setLength() : CDPL::Pharm
• setLineSpacing() : CDPL::Vis
• setLineWidth() : CDPL::Vis
• setMatchConstraints() : CDPL::Chem
• setMatchExpression() : CDPL::Chem
• setMatchExpressionString() : CDPL::Chem
• setMDLChiralFlag() : CDPL::Chem
• setMDLConfEnergySDTagParameter() : CDPL::Chem
• setMDLCTABVersion() : CDPL::Chem
• setMDLCTABVersionParameter() : CDPL::Chem
• setMDLDimensionality() : CDPL::Chem
• setMDLEnergy() : CDPL::Chem
• setMDLExternalRegistryNumber() : CDPL::Chem
• setMDLIgnoreParityParameter() : CDPL::Chem
• setMDLInternalRegistryNumber() : CDPL::Chem
• setMDLMoleculeRecord() : CDPL::Chem
• setMDLOutputConfEnergyAsSDEntryParameter() : CDPL::Chem
• setMDLOutputConfEnergyToEnergyFieldParameter() : CDPL::Chem
• setMDLParity() : CDPL::Chem
• setMDLProgramName() : CDPL::Chem
• setMDLRegistryNumber() : CDPL::Chem
• setMDLRXNFileVersion() : CDPL::Chem
• setMDLRXNFileVersionParameter() : CDPL::Chem
• setMDLScalingFactor1() : CDPL::Chem
• setMDLScalingFactor2() : CDPL::Chem
• setMDLStereoCareFlag() : CDPL::Chem
• setMDLTrimLinesParameter() : CDPL::Chem
• setMDLTrimStringsParameter() : CDPL::Chem
• setMDLTruncateLinesParameter() : CDPL::Chem
• setMDLTruncateStringsParameter() : CDPL::Chem
• setMDLUpdateTimestampParameter() : CDPL::Chem
• setMDLUserInitials() : CDPL::Chem
• setMHMOPiCharge() : CDPL::MolProp
• setMHMOPiOrder() : CDPL::MolProp
• setMMFF94AromaticRings() : CDPL::ForceField
• setMMFF94Charge() : CDPL::ForceField
• setMMFF94NumericType() : CDPL::ForceField
• setMMFF94SymbolicType() : CDPL::ForceField
• setMMFF94TypeIndex() : CDPL::ForceField
• setModelNumber() : CDPL::Biomol
• setMOL2CalcFormalChargesParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2Charge() : CDPL::Chem
• setMOL2ChargeType() : CDPL::Chem
• setMOL2ChargeTypeParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2EnableAromaticBondTypesParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2EnableExtendedAtomTypesParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2MoleculeType() : CDPL::Chem
• setMOL2MoleculeTypeParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2Name() : CDPL::Chem
• setMOL2OutputSubstructuresParameter() : CDPL::Chem
• setMOL2SubstructureChain() : CDPL::Chem
• setMOL2SubstructureID() : CDPL::Chem
• setMOL2SubstructureName() : CDPL::Chem
• setMOL2SubstructureSubtype() : CDPL::Chem
• setMorganNumber() : CDPL::Chem
• setMultiConfExportParameter() : CDPL::Chem
• setMultiConfImportParameter() : CDPL::Chem
• setMultiConfInputProcessorParameter() : CDPL::Chem
• setName() : CDPL::Chem , CDPL::Grid , CDPL::Pharm
• setOccupancy() : CDPL::Biomol
• setOptionalFlag() : CDPL::Pharm
• setOrder() : CDPL::Chem
• setOrdinaryHydrogenDepleteParameter() : CDPL::Chem
• setOrientation() : CDPL::Pharm
• setOutputConfEnergyAsCommentParameter() : CDPL::Chem
• setPDBApplyDictAtomBondingToNonStdResiduesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBApplyDictAtomBondingToStdResiduesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBApplyDictAtomTypesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBApplyDictBondOrdersToNonStdResiduesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBApplyDictBondOrdersToStdResiduesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBApplyDictFormalAtomChargesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBCalcMissingFormalChargesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBData() : CDPL::Biomol
• setPDBDeduceBondOrdersFromCONECTRecordsParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBEvaluateMASTERRecordParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBFormatVersionParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBIgnoreConectRecordsParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBIgnoreFormalChargeFieldParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBPerceiveMissingBondOrdersParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBResidueDictionaryParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBTruncateLinesParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBWriteCONECTRecordsForAllBondsParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBWriteCONECTRecordsParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBWriteCONECTRecordsReflectingBondOrderParameter() : CDPL::Biomol
• setPDBWriteFormalChargesParameter() : CDPL::Biomol
• setPEOESigmaCharge() : CDPL::MolProp
• setPEOESigmaElectronegativity() : CDPL::MolProp
• setPiElectronSystems() : CDPL::Chem
• setPlusSignColor() : CDPL::Vis
• setPlusSignLineWidth() : CDPL::Vis
• setPlusSignSize() : CDPL::Vis
• setPSDAllowDuplicatesParameter() : CDPL::Pharm
• setPSDCreationModeParameter() : CDPL::Pharm
• setRadicalElectronDotSize() : CDPL::Vis
• setRadicalElectronDotSizeParameter() : CDPL::Vis
• setRadicalType() : CDPL::Chem
• setReactionAgentAlignmentParameter() : CDPL::Vis
• setReactionAgentLayoutDirectionParameter() : CDPL::Vis
• setReactionAgentLayoutParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowColorParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowHeadLengthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowHeadWidthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowLengthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowLineWidthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowShaftWidthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionArrowStyleParameter() : CDPL::Vis
• setReactionCenterLineLength() : CDPL::Vis
• setReactionCenterLineLengthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionCenterLineSpacing() : CDPL::Vis
• setReactionCenterLineSpacingParameter() : CDPL::Vis
• setReactionCenterStatus() : CDPL::Chem
• setReactionComponentLayoutDirectionParameter() : CDPL::Vis
• setReactionComponentLayoutParameter() : CDPL::Vis
• setReactionComponentMarginParameter() : CDPL::Vis
• setReactionData() : CDPL::Chem
• setReactionPlusSignColorParameter() : CDPL::Vis
• setReactionPlusSignLineWidthParameter() : CDPL::Vis
• setReactionPlusSignSizeParameter() : CDPL::Vis
• setRecordSeparatorParameter() : CDPL::Chem
• setResidueAltAtomName() : CDPL::Biomol
• setResidueAtomName() : CDPL::Biomol
• setResidueCode() : CDPL::Biomol
• setResidueInsertionCode() : CDPL::Biomol
• setResidueLeavingAtomFlag() : CDPL::Biomol
• setResidueLinkingAtomFlag() : CDPL::Biomol
• setResidueSequenceNumber() : CDPL::Biomol
• setRingFlag() : CDPL::Chem
• setRingFlags() : CDPL::Chem
• setRings() : CDPL::Chem
• setSecondaryAtomLabelFont() : CDPL::Vis
• setSecondaryAtomLabelFontParameter() : CDPL::Vis
• setSecondaryAtomLabelSize() : CDPL::Vis
• setSecondaryAtomLabelSizeParameter() : CDPL::Vis
• setSecondaryLabelFont() : CDPL::Vis
• setSecondaryLabelSize() : CDPL::Vis
• setSerialNumber() : CDPL::Biomol
• setShowAgents() : CDPL::Vis
• setShowAtomConfigurationLabelsParameter() : CDPL::Vis
• setShowAtomQueryInfosParameter() : CDPL::Vis
• setShowAtomReactionInfosParameter() : CDPL::Vis
• setShowBondConfigurationLabelsParameter() : CDPL::Vis
• setShowBondQueryInfosParameter() : CDPL::Vis
• setShowBondReactionInfosParameter() : CDPL::Vis
• setShowCarbonsParameter() : CDPL::Vis
• setShowChargesParameter() : CDPL::Vis
• setShowExplicitHydrogensParameter() : CDPL::Vis
• setShowHydrogenCountsParameter() : CDPL::Vis
• setShowIsotopesParameter() : CDPL::Vis
• setShowNonCarbonHydrogenCountsParameter() : CDPL::Vis
• setShowPlusSigns() : CDPL::Vis
• setShowProducts() : CDPL::Vis
• setShowRadicalElectronsParameter() : CDPL::Vis
• setShowReactants() : CDPL::Vis
• setShowReactionAgentsParameter() : CDPL::Vis
• setShowReactionPlusSignsParameter() : CDPL::Vis
• setShowReactionProductsParameter() : CDPL::Vis
• setShowReactionReactantsParameter() : CDPL::Vis
• setShowStereoBondsParameter() : CDPL::Vis
• setSizeAdjustmentParameter() : CDPL::Vis
• setSMILESMinStereoBondRingSizeParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESMolWriteAtomMappingIDParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESNoOrganicSubsetParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESRecordFormatParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESRxnWriteAtomMappingIDParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteAromaticBondsParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteAtomStereoParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteBondStereoParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteCanonicalFormParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteIsotopeParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteKekuleFormParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteRingBondStereoParameter() : CDPL::Chem
• setSMILESWriteSingleBondsParameter() : CDPL::Chem
• setSSSR() : CDPL::Chem
• setStereoBondHashSpacing() : CDPL::Vis
• setStereoBondHashSpacingParameter() : CDPL::Vis
• setStereoBondWedgeWidth() : CDPL::Vis
• setStereoBondWedgeWidthParameter() : CDPL::Vis
• setStereoCenterFlag() : CDPL::Chem
• setStereoDescriptor() : CDPL::Chem
• setStoichiometricNumber() : CDPL::Chem
• setStrictErrorCheckingParameter() : CDPL::Biomol , CDPL::Chem , CDPL::ConfGen , CDPL::Grid , CDPL::Pharm
• setStructureData() : CDPL::Chem
• setSubstructure() : CDPL::Pharm
• setSybylType() : CDPL::Chem
• setSymbol() : CDPL::Chem
• setSymmetryClass() : CDPL::Chem
• setTargetFeatureType() : CDPL::GRAIL
• setTimestamp() : CDPL::Chem
• setTolerance() : CDPL::Pharm
• setTopologicalDistanceMatrix() : CDPL::Chem
• setTripleBondTrimLength() : CDPL::Vis
• setTripleBondTrimLengthParameter() : CDPL::Vis
• setType() : CDPL::Chem , CDPL::Pharm
• setUFFType() : CDPL::ForceField
• setUnpairedElectronCount() : CDPL::Chem
• setupFixedSubstructureData() : CDPL::ConfGen
• setUseCalculatedAtomCoordinatesParameter() : CDPL::Vis
• setViewportParameter() : CDPL::Vis
• setWeight() : CDPL::Pharm
• setXYZCalcFormalChargesParameter() : CDPL::Chem
• setXYZCommentIsNameParameter() : CDPL::Chem
• setXYZPerceiveBondOrdersParameter() : CDPL::Chem
• setXYZPerceiveConnectivityParameter() : CDPL::Chem
• Sg : CDPL::Chem::AtomType
• SHOW_AGENTS : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• SHOW_ATOM_CONFIGURATION_LABELS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_ATOM_QUERY_INFOS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_ATOM_REACTION_INFOS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_BOND_CONFIGURATION_LABELS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_BOND_QUERY_INFOS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_BOND_REACTION_INFOS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_CARBONS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_CHARGES : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_EXPLICIT_HYDROGENS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_HYDROGEN_COUNTS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_ISOTOPES : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_NON_CARBON_HYDROGEN_COUNTS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_PLUS_SIGNS : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• SHOW_PRODUCTS : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• SHOW_RADICAL_ELECTRONS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_REACTANTS : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• SHOW_REACTION_AGENTS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_REACTION_PLUS_SIGNS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_REACTION_PRODUCTS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_REACTION_REACTANTS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SHOW_STEREO_BONDS : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• Si : CDPL::Chem::AtomType , CDPL::Chem::SybylAtomType
• Si_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• sign() : CDPL::Math
• SINGLE : CDPL::Chem::BondMatchConstraint , CDPL::Chem::SybylBondType
• SINGLET : CDPL::Chem::RadicalType
• SIZE_ADJUSTMENT : CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault
• SKIP : CDPL::Chem::INCHIReturnCode
• slice() : CDPL::Math
• Sm : CDPL::Chem::AtomType
• Sm_6_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• SMALL : CDPL::Chem::MOL2MoleculeType
• SMARTS : CDPL::Chem::DataFormat
• SMARTSMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SMARTSMoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SMARTSReactionInputHandler : CDPL::Chem
• SMARTSReactionOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILES : CDPL::Chem::DataFormat
• SMILES_BZ2 : CDPL::Chem::DataFormat
• SMILES_GZ : CDPL::Chem::DataFormat
• SMILES_MIN_STEREO_BOND_RING_SIZE : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_MOL_WRITE_ATOM_MAPPING_ID : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_NO_ORGANIC_SUBSET : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_RECORD_FORMAT : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_RXN_WRITE_ATOM_MAPPING_ID : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_AROMATIC_BONDS : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_ATOM_STEREO : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_BOND_STEREO : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_CANONICAL_FORM : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_ISOTOPE : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_KEKULE_FORM : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_RING_BOND_STEREO : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILES_WRITE_SINGLE_BONDS : CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault
• SMILESBZ2MolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILESBZ2MolecularGraphWriter : CDPL::Chem
• SMILESBZ2MoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESBZ2MoleculeReader : CDPL::Chem
• SMILESBZ2ReactionInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESBZ2ReactionOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILESBZ2ReactionReader : CDPL::Chem
• SMILESBZ2ReactionWriter : CDPL::Chem
• SMILESGZMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILESGZMolecularGraphWriter : CDPL::Chem
• SMILESGZMoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESGZMoleculeReader : CDPL::Chem
• SMILESGZReactionInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESGZReactionOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILESGZReactionReader : CDPL::Chem
• SMILESGZReactionWriter : CDPL::Chem
• SMILESMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Chem
• SMILESMoleculeInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESReactionInputHandler : CDPL::Chem
• SMILESReactionOutputHandler : CDPL::Chem
• Sn : CDPL::Chem::AtomType , CDPL::Chem::SybylAtomType
• Sn_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• solveLower() : CDPL::Math
• solveUnitLower() : CDPL::Math
• solveUnitUpper() : CDPL::Math
• solveUpper() : CDPL::Math
• SP : CDPL::Chem::AtomConfiguration , CDPL::Chem::HybridizationState
• SP1 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP2 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP2D : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP3 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP3D : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP3D2 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SP3D3 : CDPL::Chem::HybridizationState
• SparseDMatrix : CDPL::Math
• SparseDVector : CDPL::Math
• SparseFMatrix : CDPL::Math
• SparseFVector : CDPL::Math
• SparseLMatrix : CDPL::Math
• SparseLVector : CDPL::Math
• SparseULMatrix : CDPL::Math
• SparseULVector : CDPL::Math
• SPHERE : CDPL::Pharm::FeatureGeometry
• SPHERICAL : CDPL::Shape::SymmetryClass
• splitIntoFragments() : CDPL::Chem
• SQUARE_ANTIPRISMATIC : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• SQUARE_PLANAR : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• SQUARE_PYRAMIDAL : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• Sr : CDPL::Chem::AtomType
• Sr_6_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• SSSR : CDPL::Chem::MolecularGraphProperty
• SSSR_RING_COUNT : CDPL::Chem::AtomMatchConstraint
• SSSR_RING_SIZE : CDPL::Chem::AtomMatchConstraint
• STArray : CDPL::Util
• STATIC : CDPL::ForceField::MMFF94ParameterSet
• STATIC_RTOR : CDPL::ForceField::MMFF94ParameterSet
• STATIC_RTOR_XOOP : CDPL::ForceField::MMFF94ParameterSet
• STATIC_XOOP : CDPL::ForceField::MMFF94ParameterSet
• STEREO_2D_FLAG : CDPL::Chem::BondProperty , CDPL::Chem::BondPropertyDefault
• STEREO_BOND_HASH_SPACING : CDPL::Vis::BondProperty , CDPL::Vis::BondPropertyDefault , CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault , CDPL::Vis::MolecularGraphProperty , CDPL::Vis::MolecularGraphPropertyDefault
• STEREO_BOND_WEDGE_WIDTH : CDPL::Vis::BondProperty , CDPL::Vis::BondPropertyDefault , CDPL::Vis::ControlParameter , CDPL::Vis::ControlParameterDefault , CDPL::Vis::MolecularGraphProperty , CDPL::Vis::MolecularGraphPropertyDefault
• STEREO_CENTER_FLAG : CDPL::Chem::AtomProperty , CDPL::Chem::BondProperty
• STEREO_DESCRIPTOR : CDPL::Chem::AtomProperty , CDPL::Chem::AtomPropertyDefault , CDPL::Chem::BondProperty , CDPL::Chem::BondPropertyDefault
• STEREO_INVERSION : CDPL::Chem::ReactionCenterStatus
• STEREO_RETENTION : CDPL::Chem::ReactionCenterStatus
• STOCHASTIC : CDPL::ConfGen::ConformerSamplingMode
• STOICHIOMETRIC_NUMBER : CDPL::Chem::MolecularGraphProperty , CDPL::Chem::MolecularGraphPropertyDefault
• STPair : CDPL::Util
• STPairArray : CDPL::Util
• STRETCH_BEND : CDPL::ForceField::InteractionType
• STRICT_ERROR_CHECKING : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault , CDPL::Chem::ControlParameter , CDPL::Chem::ControlParameterDefault , CDPL::ConfGen::ControlParameter , CDPL::ConfGen::ControlParameterDefault , CDPL::Grid::ControlParameter , CDPL::Grid::ControlParameterDefault , CDPL::Pharm::ControlParameter , CDPL::Pharm::ControlParameterDefault
• STRUCTURE_DATA : CDPL::Chem::MolecularGraphProperty
• SUBSTRUCTURE : CDPL::Pharm::FeatureProperty
• SUCCESS : CDPL::ConfGen::ReturnCode
• SULFENIC_ACID : CDPL::Chem::TautomerizationType
• SULFONAMIDE : CDPL::Chem::RECAPRuleID
• SULFONAMIDE_N : CDPL::Chem::RECAPAtomLabel
• SULFONAMIDE_S : CDPL::Chem::RECAPAtomLabel
• sum() : CDPL::Math
• svBackSubstitution() : CDPL::Math
• svDecompose() : CDPL::Math
• SVG : CDPL::Vis::DataFormat
• SVGMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Vis
• SVGReactionOutputHandler : CDPL::Vis
• svSubstitute() : CDPL::Math
• swapRows() : CDPL::Math
• SYBYL_TYPE : CDPL::Chem::AtomProperty , CDPL::Chem::AtomPropertyDefault , CDPL::Chem::BondProperty , CDPL::Chem::BondPropertyDefault
• sybylToAtomType() : CDPL::Chem
• SYMBOL : CDPL::Chem::AtomProperty , CDPL::Chem::AtomPropertyDefault , CDPL::Chem::AtomPropertyFlag
• SYMMETRY_CLASS : CDPL::Chem::AtomProperty
• SYSTEMATIC : CDPL::ConfGen::ConformerSamplingMode