Here is a list of all namespace members with links to the namespace documentation for each member:

- p -

• P : CDPL::Chem::AtomType , CDPL::Chem::CIPDescriptor
• p : CDPL::Chem::CIPDescriptor
• P_3 : CDPL::Chem::SybylAtomType
• P_3_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• P_3_5 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• P_3_q : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• P_MONO_DI_PHOSPHINE : CDPL::MolProp::HBondAcceptorAtomType
• P_TRI_PHOSPHINE : CDPL::MolProp::HBondAcceptorAtomType
• Pa : CDPL::Chem::AtomType
• Pa_6_4 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• PACKED : CDPL::Vis::LayoutStyle
• parameterizeMMFF94Interactions() : CDPL::ConfGen
• parseSMARTS() : CDPL::Chem
• parseSMILES() : CDPL::Chem
• Pb : CDPL::Chem::AtomType
• Pb_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• Pd : CDPL::Chem::AtomType
• Pd_4_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• PDB : CDPL::Biomol::DataFormat
• PDB_APPLY_DICT_ATOM_BONDING_TO_NON_STD_RESIDUES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_APPLY_DICT_ATOM_BONDING_TO_STD_RESIDUES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_APPLY_DICT_ATOM_TYPES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_APPLY_DICT_BOND_ORDERS_TO_NON_STD_RESIDUES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_APPLY_DICT_BOND_ORDERS_TO_STD_RESIDUES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_APPLY_DICT_FORMAL_ATOM_CHARGES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_BZ2 : CDPL::Biomol::DataFormat
• PDB_CALC_MISSING_FORMAL_CHARGES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_DATA : CDPL::Biomol::MolecularGraphProperty
• PDB_DEDUCE_BOND_ORDERS_FROM_CONECT_RECORDS : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_EVALUATE_MASTER_RECORD : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_FORMAT_VERSION : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_GZ : CDPL::Biomol::DataFormat
• PDB_IGNORE_CONECT_RECORDS : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_IGNORE_FORMAL_CHARGE_FIELD : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_PERCEIVE_MISSING_BOND_ORDERS : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_RESIDUE_DICTIONARY : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_TRUNCATE_LINES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_WRITE_CONECT_RECORDS : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_WRITE_CONECT_RECORDS_FOR_ALL_BONDS : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_WRITE_CONECT_RECORDS_REFLECTING_BOND_ORDER : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDB_WRITE_FORMAL_CHARGES : CDPL::Biomol::ControlParameter , CDPL::Biomol::ControlParameterDefault
• PDBBZ2MolecularGraphOutputHandler : CDPL::Biomol
• PDBBZ2MolecularGraphWriter : CDPL::Biomol
• PDBBZ2MoleculeInputHandler : CDPL::Biomol
• PDBBZ2MoleculeReader : CDPL::Biomol
• PDBGZMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Biomol
• PDBGZMolecularGraphWriter : CDPL::Biomol
• PDBGZMoleculeInputHandler : CDPL::Biomol
• PDBGZMoleculeReader : CDPL::Biomol
• PDBMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Biomol
• PDBMoleculeInputHandler : CDPL::Biomol
• PDF : CDPL::Vis::DataFormat
• PDFMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Vis
• PDFReactionOutputHandler : CDPL::Vis
• PENTAGONAL_BIPYRAMIDAL : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• PENTAGONAL_PLANAR : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• PENTAGONAL_PYRAMIDAL : CDPL::MolProp::CoordinationGeometry
• PEOE_SIGMA_CHARGE : CDPL::MolProp::AtomProperty
• PEOE_SIGMA_ELECTRONEGATIVITY : CDPL::MolProp::AtomProperty
• PEPTIDE_AMINO_TERMINUS : CDPL::Biomol::ResidueType
• PEPTIDE_CARBOXY_TERMINUS : CDPL::Biomol::ResidueType
• PEPTIDE_LIKE : CDPL::Biomol::ResidueType
• PEPTIDE_LINKING : CDPL::Biomol::ResidueType
• perceiveAromaticSubstructure() : CDPL::Chem
• perceiveAtomMapping() : CDPL::Chem
• perceiveAtomStereoCenters() : CDPL::Chem
• perceiveBondOrders() : CDPL::Chem
• perceiveBondStereoCenters() : CDPL::Chem
• perceiveComponentGroups() : CDPL::Chem
• perceiveComponents() : CDPL::Chem
• perceiveCyclicSubstructure() : CDPL::Chem
• perceiveExtendedType() : CDPL::GRAIL
• perceiveFragmentType() : CDPL::ConfGen
• perceiveHBondAcceptorAtomTypes() : CDPL::MolProp
• perceiveHBondDonorAtomTypes() : CDPL::MolProp
• perceiveHybridizationState() : CDPL::Chem
• perceiveHybridizationStates() : CDPL::Chem
• perceiveMMFF94AromaticRings() : CDPL::ForceField
• perceivePiElectronSystems() : CDPL::Chem
• perceiveRings() : CDPL::Chem
• perceiveSSSR() : CDPL::Chem
• perceiveSybylAtomTypes() : CDPL::Chem
• perceiveSybylType() : CDPL::Chem
• perceiveSymmetryClass() : CDPL::Shape
• perceiveSymmetryClasses() : CDPL::Chem
• perceiveUFFType() : CDPL::ForceField
• PharmacophoreReader : CDPL::Pharm
• PHOSPHINIC_ACID : CDPL::Chem::TautomerizationType
• PI_ELECTRON_SYSTEMS : CDPL::Chem::MolecularGraphProperty
• PLAIN : CDPL::Chem::BondStereoFlag
• PLANE : CDPL::Pharm::FeatureGeometry
• PLUS_SIGN_COLOR : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• PLUS_SIGN_LINE_WIDTH : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• PLUS_SIGN_SIZE : CDPL::Vis::ReactionProperty , CDPL::Vis::ReactionPropertyDefault
• Pm : CDPL::Chem::AtomType
• Pm_6_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• PML : CDPL::Pharm::DataFormat
• PMLFeatureContainerOutputHandler : CDPL::Pharm
• PMLPharmacophoreInputHandler : CDPL::Pharm
• PNG : CDPL::Vis::DataFormat
• PNGMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Vis
• PNGReactionOutputHandler : CDPL::Vis
• Po : CDPL::Chem::AtomType
• Po_3_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• POSITIVE_IONIZABLE : CDPL::Pharm::FeatureType
• Pr : CDPL::Chem::AtomType
• Pr_6_3 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• prepareForConformerGeneration() : CDPL::ConfGen
• prepareForGRAILDescriptorCalculation() : CDPL::GRAIL
• prepareForPharmacophoreGeneration() : CDPL::Pharm
• prod() : CDPL::Math
• PRODUCT : CDPL::Chem::ReactionRole
• PROLATE : CDPL::Shape::SymmetryClass
• PROTEIN : CDPL::Chem::MOL2MoleculeType
• PS : CDPL::Vis::DataFormat
• PSD : CDPL::Pharm::DataFormat
• PSD_ALLOW_DUPLICATES : CDPL::Pharm::ControlParameter , CDPL::Pharm::ControlParameterDefault
• PSD_CREATION_MODE : CDPL::Pharm::ControlParameter , CDPL::Pharm::ControlParameterDefault
• PSMolecularGraphOutputHandler : CDPL::Vis
• PSReactionOutputHandler : CDPL::Vis
• Pt : CDPL::Chem::AtomType , CDPL::Chem::SybylAtomType
• Pt_4_2 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• Pu : CDPL::Chem::AtomType
• Pu_6_4 : CDPL::ForceField::UFFAtomType
• PULLMAN : CDPL::Chem::MOL2ChargeType
• pythag() : CDPL::Math