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Chemical Data Processing Library Python API - Version 1.3.0
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Class List
Class Index
Class Hierarchy
Class Members
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All
Classes
Namespaces
Functions
Variables
Pages
- s -
set2DCoordinates() :
CDPL.Chem
set2DStereoFlag() :
CDPL.Chem
set3DCoordinates() :
CDPL.Chem
set3DCoordinatesArray() :
CDPL.Chem
setAgentAlignment() :
CDPL.Vis
setAgentLayout() :
CDPL.Vis
setAgentLayoutDirection() :
CDPL.Vis
setAlignmentParameter() :
CDPL.Vis
setAltLocationID() :
CDPL.Biomol
setApplyDictAtomTypesParameter() :
CDPL.Biomol
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CDPL.Biomol
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CDPL.Chem
setAromaticityFlags() :
CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
setAtomCustomLabelFontParameter() :
CDPL.Vis
setAtomCustomLabelSize() :
CDPL.Vis
setAtomCustomLabelSizeParameter() :
CDPL.Vis
setAtomHighlightAreaBrush() :
CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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setAtomLabelFontParameter() :
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Vis
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CDPL.Biomol
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CDPL.Vis
setBondColorParameter() :
CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
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CDPL.Vis
setBondLineWidthParameter() :
CDPL.Vis
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CDPL.Chem
setBondMemberSwapStereoFixParameter() :
CDPL.Chem
setBreakAtomHighlightAreaOutlineParameter() :
CDPL.Vis
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CDPL.Biomol
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
,
CDPL.Grid
,
CDPL.Pharm
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CDPL.Biomol
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CDPL.Biomol
,
CDPL.Chem
setCIPConfiguration() :
CDPL.Chem
setCIPPriority() :
CDPL.Chem
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CDPL.Chem
setCMLOutputCompactAtomDataParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputCompactBondDataParameter() :
CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
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CDPL.Chem
setCMLOutputKekuleFormParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputMoleculeNameParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputSingleBondStereoParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputSpinMultiplicityParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputStructureDataParameter() :
CDPL.Chem
setCMLOutputXMLDeclarationParameter() :
CDPL.Chem
setColor() :
CDPL.Vis
setCombineInterferingResidueCoordinatesParameter() :
CDPL.Biomol
setComment() :
CDPL.Chem
setComponentGroupID() :
CDPL.Chem
setComponentGroups() :
CDPL.Chem
setComponentLayout() :
CDPL.Vis
setComponentLayoutDirection() :
CDPL.Vis
setComponentMargin() :
CDPL.Vis
setComponentMatchConstraints() :
CDPL.Chem
setComponents() :
CDPL.Chem
setConfigurationLabelColor() :
CDPL.Vis
setConfigurationLabelFont() :
CDPL.Vis
setConfigurationLabelSize() :
CDPL.Vis
setConfIndexNameSuffixPatternParameter() :
CDPL.Chem
setConformation() :
CDPL.Chem
setConformationIndex() :
CDPL.Chem
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CDPL.Chem
setCoordinatesDimensionParameter() :
CDPL.Chem
setCustomLabel() :
CDPL.Vis
setCustomLabelColor() :
CDPL.Vis
setCustomLabelFont() :
CDPL.Vis
setCustomLabelSize() :
CDPL.Vis
setCyclicSubstructure() :
CDPL.Chem
setDirection() :
CDPL.Chem
setDisabledFlag() :
CDPL.Pharm
setDoubleBondTrimLength() :
CDPL.Vis
setDoubleBondTrimLengthParameter() :
CDPL.Vis
setEnableAtomHighlightingParameter() :
CDPL.Vis
setEnableBondHighlightingParameter() :
CDPL.Vis
setEntityID() :
CDPL.Biomol
setFeatureType() :
CDPL.GRAIL
setFormalCharge() :
CDPL.Chem
setGeometricalDistanceMatrix() :
CDPL.Chem
setGeometry() :
CDPL.Pharm
setGridViewBorderPenParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewCellPaddingParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewColumnSeparatorPenParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewMarginParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewRowSeparatorPenParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewTextColorParameter() :
CDPL.Vis
setGridViewTextFontParameter() :
CDPL.Vis
setHashCode() :
CDPL.Chem
setHBondAcceptorType() :
CDPL.MolProp
setHBondDonorType() :
CDPL.MolProp
setHeteroAtomFlag() :
CDPL.Biomol
setHighlightAreaBrush() :
CDPL.Vis
setHighlightAreaOutlinePen() :
CDPL.Vis
setHighlightAreaOutlineWidth() :
CDPL.Vis
setHighlightAreaOutlineWidthParameter() :
CDPL.Vis
setHighlightedFlag() :
CDPL.Vis
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CDPL.Chem
setHydrogenResidueSequenceInfo() :
CDPL.Biomol
setHydrophobicity() :
CDPL.MolProp
,
CDPL.Pharm
setImplicitHydrogenCount() :
CDPL.Chem
setINCHIInputOptionsParameter() :
CDPL.Chem
setINCHIOutputOptionsParameter() :
CDPL.Chem
setIsotope() :
CDPL.Chem
setJMESeparateComponentsParameter() :
CDPL.Chem
setLabelFont() :
CDPL.Vis
setLabelMargin() :
CDPL.Vis
setLabelSize() :
CDPL.Vis
setLength() :
CDPL.Pharm
setLineSpacing() :
CDPL.Vis
setLineWidth() :
CDPL.Vis
setMatchConstraints() :
CDPL.Chem
setMatchExpression() :
CDPL.Chem
setMatchExpressionString() :
CDPL.Chem
setMDLChiralFlag() :
CDPL.Chem
setMDLConfEnergySDTagParameter() :
CDPL.Chem
setMDLCTABVersion() :
CDPL.Chem
setMDLCTABVersionParameter() :
CDPL.Chem
setMDLDimensionality() :
CDPL.Chem
setMDLEnergy() :
CDPL.Chem
setMDLExternalRegistryNumber() :
CDPL.Chem
setMDLIgnoreParityParameter() :
CDPL.Chem
setMDLInternalRegistryNumber() :
CDPL.Chem
setMDLMoleculeRecord() :
CDPL.Chem
setMDLOutputConfEnergyAsSDEntryParameter() :
CDPL.Chem
setMDLOutputConfEnergyToEnergyFieldParameter() :
CDPL.Chem
setMDLParity() :
CDPL.Chem
setMDLProgramName() :
CDPL.Chem
setMDLRegistryNumber() :
CDPL.Chem
setMDLRXNFileVersion() :
CDPL.Chem
setMDLRXNFileVersionParameter() :
CDPL.Chem
setMDLScalingFactor1() :
CDPL.Chem
setMDLScalingFactor2() :
CDPL.Chem
setMDLStereoCareFlag() :
CDPL.Chem
setMDLTrimLinesParameter() :
CDPL.Chem
setMDLTrimStringsParameter() :
CDPL.Chem
setMDLTruncateLinesParameter() :
CDPL.Chem
setMDLTruncateStringsParameter() :
CDPL.Chem
setMDLUpdateTimestampParameter() :
CDPL.Chem
setMDLUserInitials() :
CDPL.Chem
setMHMOPiCharge() :
CDPL.MolProp
setMHMOPiOrder() :
CDPL.MolProp
setMMCIFApplyDictAtomBondingParameter() :
CDPL.Biomol
setMMCIFApplyDictBondOrdersParameter() :
CDPL.Biomol
setMMCIFData() :
CDPL.Biomol
setMMCIFOutputBiopolymersAsChemCompParameter() :
CDPL.Biomol
setMMCIFOutputDataPostprocFunctionParameter() :
CDPL.Biomol
setMMFF94AromaticRings() :
CDPL.ForceField
setMMFF94Charge() :
CDPL.ForceField
setMMFF94NumericType() :
CDPL.ForceField
setMMFF94SymbolicType() :
CDPL.ForceField
setMMFF94TypeIndex() :
CDPL.ForceField
setModelNumber() :
CDPL.Biomol
setMOL2CalcFormalChargesParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2Charge() :
CDPL.Chem
setMOL2ChargeType() :
CDPL.Chem
setMOL2ChargeTypeParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2EnableAromaticBondTypesParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2EnableExtendedAtomTypesParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2MoleculeType() :
CDPL.Chem
setMOL2MoleculeTypeParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2Name() :
CDPL.Chem
setMOL2OutputFormalChargesParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2OutputSubstructuresParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2ReadPartialAsFormalChargesParameter() :
CDPL.Chem
setMOL2SubstructureChain() :
CDPL.Chem
setMOL2SubstructureID() :
CDPL.Chem
setMOL2SubstructureName() :
CDPL.Chem
setMOL2SubstructureSubtype() :
CDPL.Chem
setMorganNumber() :
CDPL.Chem
setMultiConfExportParameter() :
CDPL.Chem
setMultiConfImportParameter() :
CDPL.Chem
setMultiConfInputProcessorParameter() :
CDPL.Chem
setName() :
CDPL.Chem
,
CDPL.Grid
,
CDPL.Pharm
setOccupancy() :
CDPL.Biomol
setOptionalFlag() :
CDPL.Pharm
setOrder() :
CDPL.Chem
setOrdinaryHydrogenDepleteParameter() :
CDPL.Chem
setOrientation() :
CDPL.Pharm
setOutputConfEnergyAsCommentParameter() :
CDPL.Chem
setOutputScalingFactorParameter() :
CDPL.Vis
setPDBApplyDictAtomBondingToNonStdResiduesParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBApplyDictAtomBondingToStdResiduesParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBApplyDictBondOrdersToNonStdResiduesParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBApplyDictBondOrdersToStdResiduesParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBData() :
CDPL.Biomol
setPDBDeduceBondOrdersFromCONECTRecordsParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBEvaluateMASTERRecordParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBFormatVersionParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBIgnoreConectRecordsParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBIgnoreFormalChargeFieldParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBOutputCONECTRecordsForAllBondsParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBOutputCONECTRecordsParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBOutputCONECTRecordsReflectingBondOrderParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBOutputFormalChargesParameter() :
CDPL.Biomol
setPDBTruncateLinesParameter() :
CDPL.Biomol
setPEOESigmaCharge() :
CDPL.MolProp
setPEOESigmaElectronegativity() :
CDPL.MolProp
setPerceiveMissingBondOrdersParameter() :
CDPL.Biomol
setPiElectronSystems() :
CDPL.Chem
setPlusSignColor() :
CDPL.Vis
setPlusSignLineWidth() :
CDPL.Vis
setPlusSignSize() :
CDPL.Vis
setPSDAllowDuplicatesParameter() :
CDPL.Pharm
setPSDCreationModeParameter() :
CDPL.Pharm
setRadicalElectronDotSize() :
CDPL.Vis
setRadicalElectronDotSizeParameter() :
CDPL.Vis
setRadicalType() :
CDPL.Chem
setReactionAgentAlignmentParameter() :
CDPL.Vis
setReactionAgentLayoutDirectionParameter() :
CDPL.Vis
setReactionAgentLayoutParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowColorParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowHeadLengthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowHeadWidthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowLengthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowLineWidthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowShaftWidthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionArrowStyleParameter() :
CDPL.Vis
setReactionCenterLineLength() :
CDPL.Vis
setReactionCenterLineLengthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionCenterLineSpacing() :
CDPL.Vis
setReactionCenterLineSpacingParameter() :
CDPL.Vis
setReactionCenterStatus() :
CDPL.Chem
setReactionComponentLayoutDirectionParameter() :
CDPL.Vis
setReactionComponentLayoutParameter() :
CDPL.Vis
setReactionComponentMarginParameter() :
CDPL.Vis
setReactionData() :
CDPL.Chem
setReactionPlusSignColorParameter() :
CDPL.Vis
setReactionPlusSignLineWidthParameter() :
CDPL.Vis
setReactionPlusSignSizeParameter() :
CDPL.Vis
setRecordSeparatorParameter() :
CDPL.Chem
setResidueAltAtomName() :
CDPL.Biomol
setResidueAtomName() :
CDPL.Biomol
setResidueCode() :
CDPL.Biomol
setResidueDictionaryParameter() :
CDPL.Biomol
setResidueInsertionCode() :
CDPL.Biomol
setResidueLeavingAtomFlag() :
CDPL.Biomol
setResidueLinkingAtomFlag() :
CDPL.Biomol
setResidueSequenceNumber() :
CDPL.Biomol
setRingFlag() :
CDPL.Chem
setRingFlags() :
CDPL.Chem
setRings() :
CDPL.Chem
setSecondaryAtomLabelFont() :
CDPL.Vis
setSecondaryAtomLabelFontParameter() :
CDPL.Vis
setSecondaryAtomLabelSize() :
CDPL.Vis
setSecondaryAtomLabelSizeParameter() :
CDPL.Vis
setSecondaryLabelFont() :
CDPL.Vis
setSecondaryLabelSize() :
CDPL.Vis
setSerialNumber() :
CDPL.Biomol
setShowAgents() :
CDPL.Vis
setShowAtomConfigurationLabelsParameter() :
CDPL.Vis
setShowAtomCustomLabelsParameter() :
CDPL.Vis
setShowAtomQueryInfosParameter() :
CDPL.Vis
setShowAtomReactionInfosParameter() :
CDPL.Vis
setShowBondConfigurationLabelsParameter() :
CDPL.Vis
setShowBondCustomLabelsParameter() :
CDPL.Vis
setShowBondQueryInfosParameter() :
CDPL.Vis
setShowBondReactionInfosParameter() :
CDPL.Vis
setShowCarbonsParameter() :
CDPL.Vis
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CDPL.Vis
setShowExplicitHydrogensParameter() :
CDPL.Vis
setShowHydrogenCountsParameter() :
CDPL.Vis
setShowIsotopesParameter() :
CDPL.Vis
setShowNonCarbonHydrogenCountsParameter() :
CDPL.Vis
setShowPlusSigns() :
CDPL.Vis
setShowProducts() :
CDPL.Vis
setShowRadicalElectronsParameter() :
CDPL.Vis
setShowReactants() :
CDPL.Vis
setShowReactionAgentsParameter() :
CDPL.Vis
setShowReactionPlusSignsParameter() :
CDPL.Vis
setShowReactionProductsParameter() :
CDPL.Vis
setShowReactionReactantsParameter() :
CDPL.Vis
setShowStereoBondsParameter() :
CDPL.Vis
setSizeAdjustmentParameter() :
CDPL.Vis
setSMILESMinStereoBondRingSizeParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESMolOutputAtomMappingIDParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESNoOrganicSubsetParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputAromaticBondsParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputAtomStereoParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputBondStereoParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputCanonicalFormParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputIsotopeParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputKekuleFormParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputRingBondStereoParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESOutputSingleBondsParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESRecordFormatParameter() :
CDPL.Chem
setSMILESRxnOutputAtomMappingIDParameter() :
CDPL.Chem
setSSSR() :
CDPL.Chem
setStereoBondHashSpacing() :
CDPL.Vis
setStereoBondHashSpacingParameter() :
CDPL.Vis
setStereoBondWedgeWidth() :
CDPL.Vis
setStereoBondWedgeWidthParameter() :
CDPL.Vis
setStereoCenterFlag() :
CDPL.Chem
setStereoDescriptor() :
CDPL.Chem
setStoichiometricNumber() :
CDPL.Chem
setStrictErrorCheckingParameter() :
CDPL.Biomol
,
CDPL.Chem
,
CDPL.ConfGen
,
CDPL.Grid
,
CDPL.Pharm
setStructureData() :
CDPL.Chem
setSubstructure() :
CDPL.Pharm
setSybylType() :
CDPL.Chem
setSymbol() :
CDPL.Chem
setSymmetryClass() :
CDPL.Chem
setTargetFeatureType() :
CDPL.GRAIL
setTimestamp() :
CDPL.Chem
setTolerance() :
CDPL.Pharm
setTopologicalDistanceMatrix() :
CDPL.Chem
setTripleBondTrimLength() :
CDPL.Vis
setTripleBondTrimLengthParameter() :
CDPL.Vis
setType() :
CDPL.Chem
,
CDPL.Pharm
setUFFType() :
CDPL.ForceField
setUnpairedElectronCount() :
CDPL.Chem
setupFixedSubstructureData() :
CDPL.ConfGen
setUseCalculatedAtomCoordinatesParameter() :
CDPL.Vis
setViewportParameter() :
CDPL.Vis
setWeight() :
CDPL.Pharm
setXYZCalcFormalChargesParameter() :
CDPL.Chem
setXYZCommentIsNameParameter() :
CDPL.Chem
setXYZPerceiveBondOrdersParameter() :
CDPL.Chem
setXYZPerceiveConnectivityParameter() :
CDPL.Chem
sign() :
CDPL.Math
slice() :
CDPL.Math
solveLower() :
CDPL.Math
solveUnitLower() :
CDPL.Math
solveUnitUpper() :
CDPL.Math
solveUpper() :
CDPL.Math
splitIntoFragments() :
CDPL.Chem
sum() :
CDPL.Math
svDecompose() :
CDPL.Math
svSubstitute() :
CDPL.Math
sybylToAtomType() :
CDPL.Chem
Generated by
1.9.1