- a -

• addConformation() : CDPL::Chem
• align2DCoordinates() : CDPL::Chem
• align3DCoordinates() : CDPL::Chem
• alignConformations() : CDPL::Chem
• angleCos() : CDPL::Math
• applyConformation() : CDPL::Chem
• areInSameResidue() : CDPL::Biomol
• assignMMFF94AtomTypes() : CDPL::ForceField
• assignMMFF94BondTypeIndices() : CDPL::ForceField
• assignUFFAtomTypes() : CDPL::ForceField
• atomTypesMatch() : CDPL::Chem