add14DistanceConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addAtomConfigurationConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addAtomPlanarityConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addAtomStereoCenter(const Chem::Atom &atom, const Chem::StereoDescriptor &descr) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addBondAngleConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addBondConfigurationConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addBondLengthConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addBondPlanarityConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addBondStereoCenter(const Chem::Bond &bond, const Chem::StereoDescriptor &descr) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addDefaultDistanceConstraints(Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
addFixedSubstructureConstraints(const Chem::AtomContainer &atoms, const Math::Vector3DArray &coords, Util::DG3DCoordinatesGenerator &coords_gen) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
ConstStereoCenterDataIterator typedef | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
DGConstraintGenerator() | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getAtomStereoCenterData(std::size_t idx) const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getAtomStereoCenterDataBegin() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getAtomStereoCenterDataEnd() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getBondStereoCenterData(std::size_t idx) const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getBondStereoCenterDataBegin() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getBondStereoCenterDataEnd() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getExcludedHydrogenMask() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getNumAtomStereoCenters() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getNumBondStereoCenters() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getSettings() | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
getSettings() const | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
setup(const Chem::MolecularGraph &molgraph) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
setup(const Chem::MolecularGraph &molgraph, const ForceField::MMFF94InteractionData &ia_data) | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |
StereoCenterData typedef | CDPL::ConfGen::DGConstraintGenerator | |